Как вариант
Если памяти не хватает на весь проект сразу,
то можно разбить на части и по частям выполнить преобразование сеток в тела.
потом пробовать собрать в один файл.
Я не совсем уловил
зачем потребовалось преобразовывать сразу ВЕСЬ огромный файл из сетки в тела.
Чтобы потом из него делать проекции и разрезы?
Нормально Работать с восстановленными из сетки телами не получится.
Точнее с большинством из них.
Легче оставить объекты в сетке для просмотра.
Но если очень надо, то лучше подумать как автоматизировать восстановл